Thierry NADALIG

Maître de Conférences

Adresse :


Université de Strasbourg / CNRS UMR 7156
Génétique Moléculaire, Génomique, Microbiologie.               
4 Allée Konrad Roentgen
67000 Strasbourg


 : + 33 (0)368851973
 : nadalig@unistra.fr

Titres universitaires

  • 1994-98: Doctorat en Océanographie, Spécialité : Biogéochimie de l'Environnement.Univ.Bordeaux 1.
    "Etude de la dégradation bactérienne des hydrocarbures aromatiques polycycliques en conditions oxiques". Directeurs de thèse : Pr P. Caumette et Dr P. Garrigues.
  • 1993-94 : DEA en Océanographie. Université Bordeaux 1.
    "Etude de la dégradation bactérienne des hydrocarbures aromatiques polycycliques en conditions oxiques et anoxiques". Sous la direction de :  Mme H. Budzinski (CR, Université Bordeaux 1) et Mme N. Raymond (MCF, Université Bordeaux 1).
  • 1992-93 : DESS Informatique "Double Compétence". Univ. F. Rabelais, Tours.
  • 1991-92 : Maîtrise de chimie bio-organique Univ. F. Rabelais, Tours.
  • 1990-91 : Licence de chimie. Univ. F. Rabelais, Tours.
  • 1989-90 : DEUG B. "Sciences de la Nature et de la Vie" Univ. F. Rabelais, Tours.

Expériences post-doctorales

  • 2002-2003 : Contrat post-doctoral au centre IFREMER de Brest, Département des Recherches Océaniques/ Environnement Profond. "Ecologie bactérienne des sites de suintements froids (hydrocarbures, méthane) en milieu marin profond"
  • 2001-2002 : Contrat post-doctoral à l'Institut Alfred Wegener de Bremerhaven (Allemagne). "Etude microbiologique des sédiments d'un volcan de boue Hakon Mosby"
  • 1999-2001: Contrat post-doctoral au centre IFREMER de Brest, Département des Recherches
    Océaniques/ Environnement Profond. "Ecologie bactérienne des sites de suintements froids (hydrocarbures, méthane) en milieu marin profond"
  • 1998-99: Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche (ATER). U.F.R de Biologie.Université Bordeaux 1. Laboratoire d'Océanographie Biologique d'Arcachon en collaboration avec le Dr Natalie Raymond (MCF).
  • 1998 : Contrat post-doctoral, Institüt Max-Planck für marine Mikrobiologie, Brême, Allemagne. "Bacterial degradation of hydrocarbons under anoxic conditions" sous la direction du Pr Widdel.

Campagnes océanographiques

  • Août 2000 : (7 jours) N/O Thalassa, Etude de zones de suintements froids dans le Golfe de Guinée.
  • Décembre 2000 - Janvier 2001 : (4 semaines) N/O Atalante et ROV Victor 6000, Etude de zones de suintements froids dans le Golfe de Guinée.
  • Août 2001 - Septembre 2001 : (4 semaines) N/O Atalante et ROV Victor 6000, Etude d'un volcan de boue Hakon Mosby. Coopération Franco-Allemande.
  • Novembre 2001 : (3 semaines) N/O Atalante et ROV Victor 6000, Etude de zones de suintements froids dans le Golfe de Guinée.

Publications

Jarrige, D., Haridas, S., Bleykasten-Grosshans, C., Joly, M., Nadalig, T., Sancelme, M., Vuilleumier, S., Grigoriev, I., Amato, P. & Bringel, F. (2022) High-quality genome of the basidiomycete yeast Dioszegia hungarica PDD-24b-2 isolated from cloud water. Genes Genomes Genetics.

Jarrige, D., Nadalig, T., Joly, M., Sancelme, M., Vuilleumier, S., Amato, P. & Bringel, F.(2022) Complete genome of Sphingomonas aerolata PDD-32b-11, isolated from cloud water at the summit of puy de Dôme, France. Microbiology Resource Announcements, 11 (10) e00684-22.

Keppler, F., Barnes, J.D., Horst, A., Bahlmann, E., Luo, J., Nadalig, T., Greule, M., Hartmann, S.C.,  & Vuilleumier, S. (2020) Chlorine isotope fractionation of the major chloromethane degradation processes in the environment. Environ. Sci. Technol.54, 3, 1634-1645.

Bringel, F., Besaury, L., Amato, P., Kröber, E., Kolb, S., Keppler, F., Vuilleumier, S. & Nadalig, T. (2019) Methylotrophs and Methylotroph Populations for Chloromethane Degradation. In Methylotrophs and Methylotroph Communities, Ed : L. Chistoserdova, Caister Academic Press, Chap. 8, 149-171.

Jaeger, N., Besaury, L., Röhling, A.N., Koch, F., Delort, A.-M., Gasc, C., Greule, M.,  Kolb, S., Nadalig, T., Peyret, P., Vuilleumier, S., Amato, P., Bringel, F. &  Keppler, F. (2018) Chloromethane formation and degradation in the fern phyllosphere. Sci. Total Environ. 634, 1278-1287.

Jaeger, N., , Besaury, L., Kröber, E., Delort, A-M, Greule, M., Lenhart, K., Nadalig, T., Vuilleumier, S., Amato, P., Kolb, S., Bringel, F. & Keppler, F. (2018) Chloromethane degradation in soils - a combined microbial and two-dimensional stable isotope approach. J. Environ.Qual.47, 254-262.

Farhan Ul Haque, M., Besaury., L., Nadalig, T., Bringel, F., Mutterer, J., Schaller, H. & Vuilleumier, S. (2017) Correlated production and consumption of chloromethane in the Arabidopsis thaliana phyllosphere.  Scientific Reports7, 17589.

Bringel, F., Postema, C.P., Mangenot, S., Bibi-Triki, S., Chaignaud, P., Farhan Ul Haque, M., Gruffaz, C., Hermon, L., Louhichi, Y., Maucourt, B., Muller, E.E.L., Nadalig, T., Lajus, A., Rouy, Z., Médigue, C., Barbe, V., Janssen, D.B. & Vuilleumier, S. (2017) Genome sequence of the dichloromethane-degrading bacterium Hyphomicrobium sp. strain GJ21. Genome Announc. 5, art. 00622-17

Penny, C., Gruffaz, C., Nadalig, T., Cauchie, H.-M., Vuilleumier, S. & Bringel, F. (2015) Tetrachloromethane-degrading bacterial enrichment cultures and isolates from a contaminated aquifer. Microorganisms 3, 327-343.

Nadalig, T., Greule, M., Bringel, F., Keppler, F. & Vuilleumier, S. (2014) Probing the diversity of chloromethane-degrading bacteria by comparative genomics and isotopic fractionation. Front. Microbiol.5: 523.

Nadalig, T., Greule, M., Bringel, F., Vuilleumier, S. & Keppler, F. (2013) Hydrogen and carbon isotope fractionation during degradation of chloromethane by methylotrophic bacteria. MicrobiologyOpen 2 (6), 893-900.

Farhan Ul Haque, MF., Nadalig, T., Bringel, F., Schaller, H. & Vuilleumier, S. (2013) A fluorescence-based bacterial bioreporter for the specific detection of methyl halide emissions in the environment. Appl. Environ. Microbiol.79, 6561-6567.

Roselli, S., Nadalig, T., Vuilleumier, S. & Bringel, F. (2013) The 380 kb pCMU01 plasmid encodes chloromethane utilization genes and redundant genes for vitamin B12- and tetrahydrofolate-dependent chloromethane metabolism in Methylobacterium extorquens CM4: A proteomic and bioinformatics study. PLoS ONE8(4), e56598.

Marx, C.J., Bringel, F., Chistoserdova, L., Moulin, L., Farhan Ul Haque, M., Fleischman, D.E., Gruffaz, C., Jourand, P., Knief, C., Lee, M-C., Muller, E.E.L., Nadalig, T., Peyraud, R., Roselli, S., Russ, L., Goodwin, L.A., Ivanova, N., Kyrpides, N., Lajus, A., Land, M.L., Médigue, C., Mikhailova, N., Nolan, M., Woyke, T., Stolyar, S., Vorholt, J.A. & Vuilleumier, S. (2012). Complete genome sequences of six strains of the genus Methylobacterium. J. Bacteriol. 194, 4746-4748.

Vuilleumier, S., Nadalig, T., Farhan Ul Haque, M., Magdelenat, G., Lajus, A., Roselli, S., Muller, E.E.L., Gruffaz, C., Barbe, V., Médigue, C. & Bringel, F. (2011) Complete genome sequence of the chloromethane-degrading strain Hyphomicrobium sp. strain MC1. J. Bacteriol.193, 5035-5036

Nadalig, T., Farhan Ul Haque, M., Roselli, S., Schaller, H., Bringel, F. & Vuilleumier, S. (2011) Detection and isolation of chloromethane-degrading bacteria from the Arabidopsis thaliana phyllosphere, and characterization of chloromethane utilisation genes. FEMS Microbiol. Ecol. 77, 438-448.

Penny, C., Nadalig, T., Alioua, M., Gruffaz, C., Vuilleumier, S. & Bringel, F. (2010). Coupling of denaturing high-performance liquid chromatography and terminal restriction fragment length polymorphism with precise fragment size calling for microbial community profiling and characterization. Appl. Environ. Microbiol.76, 648-651.

Cambon-Bonavita, M. A., Nadalig, T., Roussel, E., Delage, E., Duperron, S., Caprais, J.-C., Boetius, A. & Sibuet, M. (2009). Diversity and distribution of methane oxidizing microbial communities associated with different faunal assemblages in a giant pockmark of the Gabon continental margin. Deep-Sea ResearchII, 53, 2248-2258

Vuilleumier, S., Chistoserdova, L., Lee, M.-C., Bringel, F., Lajus, A., Zhou, Y., Gourion, B., Barbe, V., Chang, J., Cruveiller, S., Dossat, C., Gillett, W., Gruffaz, C., Haugen, E., Hourcade, E., Levy, R., Mangenot, S., Muller, E., Nadalig, T., Pagni, M., Penny, C., Peyraud, R., Robinson, D.G., Roche, D., Rouy, Z., Saenampechek, C., Salvignol, G., Vallenet, D., Wu, Z., Marx, C.J., Vorholt, J.A., Olson, M. V., Kaul, R., Weissenbach, J., Médigue, C. & Lidstrom, M.E. (2009). Methylobacterium genome sequences: a reference blueprint to investigate microbial metabolism of C1 compounds from natural and industrial sources. PLoS ONE4, e5584.

David, M., Bringel, F., Pagni, M., Gilmartin, N., Boubakri, H., Nadalig, T., Simonet, P., Vogel, T. & Vuilleumier, S. (2008). Diversité et évolution des déshalogénases bactériennes : détection bioinformatique et perspectives de recherche. Les Actes du BRG7, 83-94.

Losekann, T., Knittel, K., Nadalig, T., Fuchs, B., Niemann, H., Boetius, A. & Amann, R. (2007). Diversity and abundance of aerobic and anaerobic methane oxidizers at the Haakon Mosby mud volcano, Barents sea. Appl. Environ. Microbiol.73, 3348-3362.

Niemann, H., Losekann, T., de Beer, D., Elvert, M., Nadalig, T., Knittel, K., Amann, R., Sauter, E.J., Schluter, M., Klages, M., Foucher, J.P. & Boetius, A. (2006). Novel microbial communities of the Haakon Mosby mud volcano and their role as a methane sink. Nature443, 854-858.

Ondréas, H., Olu, K., Fouquet, Y., Charlou, J.-L., Gay, A., Dennielou, B., Donval, J.-P., Fifis, A., Nadalig, T., Cochonat, P., Cauquil, E. & Sibuet, M. (2006). ROV study of a giant pockmark on the Gabon continental margin. Geo-Marine Lett.25, 281-292.

Duperron, S., Nadalig, T., Caprais, J. C., Sibuet, M., Fiala-Medioni, A., Amann, R. & Dubilier, N. (2005). Dual symbiosis in a Bathymodiolus sp. mussel from a methane seep on the gabon continental margin (southeast Atlantic): 16S rRNA phylogeny and distribution of the symbionts in gills. Appl. Environ. Microbiol.71, 1694-1700.

Nadalig T., Raymond N., Ni'matuzahroh, Gilewicz M., Caumette P., & Budzinski H. (2002). Degradation of phenanthrene, methylphenanthrenes and dibenzothiophene by a Sphingomonas sp. strain 2MPII. Appl. Microbiol. Biot. 59, 79-85

Budzinski H., Nadalig T., Raymond N, Ni'matuzahroh & Gilewicz M. (2000) Evidence of two metabolic pathways for the degradation of 2-methylphenanthrene by a Sphingomonas sp. strain 2MPII. Environ. Toxicol. Chem. 19, 2672-2677

Nadalig T., Raymond N., Gilewicz M. & Budzinski H. (2000) Development of a protocol to study aerobic bacterial degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons: application to phenanthrenes. Polycycl. Aromat. Comp., 18, 177-192

Budzinski H., Raymond N., Nadalig T., Garrigues P., & Caumette P. (1998) Aerobic biodegradation of alkylated aromatic hydrocarbons by a bacterial community. Org. Geochem.28, 337-348

Gilewicz M., Ni'matuzahroh , Nadalig T., Budzinski H., Doumenq P., Michotey V. & Bertrand J.C. (1997) Isolation and characterization of a marine bacterium capable of utilizing 2-methylphenanthrene.Appl. Microbiol. Biot, , 48, 528-533

Nadalig T., Budzinski H., Raymond N., Garrigues P. & Caumette P. (1996) Aerobic degradation of methyl-phenanthrenes by an enrichment bacterial community. Polycycl. Aromat. Comp.11, 107-114